Genomitestin yhteydessä automaattisesti julkaistaviin tuloksiin on joulukuussa 2022 lisätty herefordin MD (Mandibulofacial Dysostosis) ja tammikuussa 2023 herefordin MSUD (Maple Syrup Urine Disease). Tulokset julkaistaan automaattisesti genomitestauksen yhteydessä. Tulokset ovat nähtävissä Minun Maatilani –palvelun tai kantakirjatodistuksen kautta.
<a href="http://www.faba.fi/fi/genomitestaus">Genomitestin</a> pääset tilaamaan MinunMaatilani.fi -palvelun kautta.
Tuloksia on tallennettu takautuvasti myös aikaisemmin testatuille eläimille. MSUD on ollut genomitestisirulla pitkään, joten tuloksia on saatu lähes kaikille tähän mennessä genomitestatuille hereford-eläimille. MD saatiin uutena ominaisuutena nykyiselle genomitestisirulle. Nykyinen genomitestisiru on otettu käyttöön joulukuussa 2021, joten käytännössä takautuva tuloksia saatiin vain vuoden 2022 aikana genomitestatuille eläimille.
Lisätietoja oireista löytyy <a href="http://www.faba.fi/fi/lihakarjan-dna-maaritykset">Lihakarjan DNA-määritykset -sivulta.</a>
&nbsp;
Tulokset tallennetaan tietokantaan seuraavasti:
MD (Mandibulofacial Dysostosis) 
MDF = vapaa      MDC = heterotsygootti kantaja      MDS = homotsygootti kantaja eli sairas
MSUD (Maple Syrup Urine Disease) 
MSU1F = vapaa      MSU1C = heterotsygootti kantaja      MSU1S = homotsygootti kantaja eli sairas
<div>
<div></div>
<div>HUOM! MSUD:n tuloskoodit on päivitetty vuodenvaihteessa 2022-2023.</div>
<div>Sairautta tavataan myös shorthorn-rodulla, joten tuloskoodit on eroteltu seuraavasti:</div>
<div>1 = Hereford</div>
<div>2 = Shorthorn</div>
</div>
&nbsp;
Hyödylliset linkit:
<a href="https://wordpress.faba.fi/fi/karjan-kehittaminen/genomitestaus/">Genomitestaus, MM.fin näyteseuranta</a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/fi/karjan-hyvinvointi/dna-maaritykset/lihakarjan-dna-maaritykset/">Oirekuvaukset, testaustiedot</a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/fi/karjan-hyvinvointi/dna-maaritykset/nautojen-perinnolliset-sairaudet/">Lisätiedot, tuloskoodit</a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/wp-content/uploads/2022/08/Genomitestitilauksen-tekeminen-MM.fissä_Asiakasohje.pdf" target="_blank" rel="noopener">Genomitestitilauksen tekeminen MM.fi </a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/wp-content/uploads/2022/08/Tilausohjelman-käyttöönotto-MM.fissä_Asiakasohje.pdf" target="_blank" rel="noopener">Genomitestitialusohjelman käyttöönotto</a>
Lisätietoja 
Fabalab, <a href="mailto:fabalab@faba.fi">fabalab@faba.fi</a>

robots

generator

https://wordpress.faba.fi/wp-content/uploads/2022/11/cropped-faba-favicon-270x270.png

msapplication-TileImage

<h3>Liharotujen genomitestaus </h3>
Liharotujen ensimmäinen genomiarvostelun tulokset julkaistaan vuoden 2023 ensimmäisen arvostelun yhteydessä maaliskuussa. Tässä tiedotteessa on tiivistelmä genomiarvostelutilanteen tämän hetkisestä tilanteesta.
Tilaa tulevalla poikimakaudella syntyville vasikoille DNA-korvamerkit, niin genomitestaus onnistuu helpoiten.
Genomitestillä voidaan määrittää eläimen jalostusarvo DNA:n avulla. Genomi-indeksit kertovat jo vasikkana millaisia geenejä eläin tulee jättämään jälkeläisilleen. Näin vauhditetaan karjan tavoitteiden toteutumista! 
<h3>Genomitestin hinta (lihakarja) </h3>
<ul>
<li data-leveltext="" data-font="Symbol" data-listid="16" data-list-defn-props="{&quot;335552541&quot;:1,&quot;335559684&quot;:-2,&quot;335559685&quot;:720,&quot;335559991&quot;:360,&quot;469769226&quot;:&quot;Symbol&quot;,&quot;469769242&quot;:[8226],&quot;469777803&quot;:&quot;left&quot;,&quot;469777804&quot;:&quot;&quot;,&quot;469777815&quot;:&quot;hybridMultilevel&quot;}" data-aria-posinset="1" data-aria-level="1">Kaikki näytetyypit 24,30 e / näyte + alv  </li>
</ul>
  Laskurivit muodostuvat, kun näyte toimitetaan analysoitavaksi. Laskut toimitetaan asiakkaille kuun vaihteessa.   
<h3>Genomitestien tilaaminen   </h3>
Genomitestejä pääsee tilaamaan Minun Maatilani -palvelun kautta. Ohjeet tilausohjelman käyttöönottoon ja käyttöön löytyvät Faban kotisivuilta: Karjan kehittäminen &gt; Genomitestaus. Tilausten tekeminen ennen näytteiden lähettämistä nopeuttaa näytteiden käsittelyä huomattavasti. 
Allflexin DNA-korvamerkit tilausohjelma tunnistaa automaattisesti. Jos käytössä on AgroTag Genomerkit, voi näytetyypin vaihtaa kudosnäytteeksi näytetyyppivalikon kautta.    
<h3>DNA-korvamerkit   </h3>
Näytteenotto sujuu helpoiten DNA-korvamerkeillä. HUOM! DNA-korvamerkkeihin ei automaattisesti sisälly genomitestitilausta. Näytteitä ei käsitellä, jos niille ei ole tehty genomitestitilausta. Näytteiden jouhevan käsittelyn takaamiseksi on tärkeää tarkistaa genomitestitilaukset ja mahdolliset poistettavat näytteet ennen näytteiden lähettämistä.   
<h3>Näyteseuranta Minun Maatilani -palvelussa   </h3>
Genomitestien etenemistä voi seurata aina tilauksesta tuloksiin Minun Maatilani -palvelun kautta. Näyteseuranta -toiminto on osa muokattavia raportteja. Ohjeet näyteseurannan käyttöönottoon ja tulkintaan löytyvät Faban kotisivuilta: Karjan kehittäminen &gt; Genomitestaus.  
<h3>Genomiset jalostusarvot  </h3>
Ensimmäiset genomiset jalostusarvot julkaistaan vuoden 2023 ensimmäisen liharotujen arvostelun yhteydessä. Laskenta alkaa 20.3.2023 maanantaina. Jotta eläin on mukana laskennassa, DNA-näytteen pitää olla toimitettu Fabalabiin viimeistään 20.1.2023 mennessä. Genomiset jalostusarvot lasketaan seuraaville roduille: aberdeen angus, hereford, charolais, limousin ja simmental. 
Koko liharotujen jalostusarvojen laskentajärjestelmä uudistuu siten, että siirrytään käyttämään ns. monen rodun single-step-mallia. Kaikki informaatio on laskennassa samalla kertaa mukana ja myös ensimmäisen polven risteytykset tulevat saamaan jalostusarvot. 
<h3>Genomitestin yhteydessä automaattisesti julkaistavat DNA-tulokset tautigeeneistä ja perinnöllisistä ominaisuuksista  </h3>
Genomitestauksen yhteydessä julkaistaan automaattisesti useita DNA-tuloksia tautigeenien ja perinnöllisten ominaisuuksien suhteen. Tutkittava eläin tarkistetaan kaikkien saatavilla olevien testien suhteen, mutta tulosten julkaisussa käytetään roturajoitteita, jotta tulosjoukko pysyy luettavana. Rodulle tärkeiden tulosten lisäksi kaikki tautigeenien kantaja-tulokset julkaistaan rodusta riippumatta. Tulokset näkyvät Minun Maatilani -palvelussa näyteseurannan ja eläimen eläinkortin kautta. Ajantasainen lista automaattisesti julkaistavista tuloksista löytyy Faban kotisivuilta: Karjan kehittäminen &gt; Genomitestaus. Tällä hetkellä julkaistavia tuloksia ovat:

<table data-tablestyle="MsoTableGrid" data-tablelook="1184">
<tbody>
<tr>
<td data-celllook="4369">Automaattisesti julkaistavat DNA-tulokset </td>
<td data-celllook="4352">AAN </td>
<td data-celllook="0">CHA </td>
<td data-celllook="0">HER </td>
<td data-celllook="0">LIM </td>
<td data-celllook="0">SIM </td>
</tr>
<tr>
<td data-celllook="1">Ataksia </td>
<td data-celllook="1"> </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
</tr>
<tr>
<td data-celllook="0">Brown Swiss Haplotype 2, BH2 </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
</tr>
<tr>
<td data-celllook="0">Developmental Duplication, DD </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
</tr>
<tr>
<td data-celllook="0">Hypotrikoosi, HY </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
</tr>
<tr>
<td data-celllook="0">Mandibulofacial Dysostosis, MD    *UUTTA 11/2022* </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
</tr>
<tr>
<td data-celllook="0">Nupous </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
</tr>
<tr>
<td data-celllook="0">Retinitis Pigmentosa 1, RP1 </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
</tr>
</tbody>
</table>

<h3>Polveutumisen vahvistuminen / SNP-polveutumismääritys  </h3>
Eläimen polveutuminen tarkistetaan genomitestin yhteydessä automaattisesti, jos emä ja/tai isä on jo aiemmin genomitestattu. Sopivia sukulaisia etsitään kaikkien genomitestattujen eläinten joukosta. Mikäli DNA-tulosten ja rekisteriin merkittyjen polveutumistietojen välillä havaitaan ristiriitaa, eläin saa ”ilmennyt epäselvyys” -merkinnän. Fabalab käsittelee merkinnän saaneiden eläinten eli nk. virhelistan tietoja automaattisesti ja ottaa tilaan yhteyttä. Jos emä on genomitestattu ja emäksi vahvistunut ja isätiedon suhteen havaitaan ristiriitaa, isätiedon muutos käsitellään automaattisesti ilman erillistä yhteydenottoa. Tila saa tehdystä isätiedon muutoksesta automaattisen ilmoituksen sähköpostilla.  
SNP-polveutumismääritys perustuu genomitestaukseen eli määrityksen yhteydessä eläimelle julkaistaan kaikki samat DNA-tulokset kuin genomitestauksen yhteydessä. SNP-polveutumismäärityksen ja genomitestauksen ero tulee tavasta, jolla Fabalab käsittelee näytteitä ja tuloksia. SNP-polveutumismäärityksen tilaamista suositellaan, jos polveutumistiedoissa epäillään virhettä, eläimen isä ja/tai emä genomitestataan samaan aikaan jälkeläisen kanssa tai eläin ei täytä genomitestauksen kriteereitä. Lisätiedot ja tilaukset: fabalab@faba.fi.  
<div class="blog-share text-center">
<div class="is-divider medium"></div>
</div>

Genomitestin yhteydessä automaattisesti julkaistaviin tuloksiin on viikolla 1 lisätty anguksen DD (Developmental Duplication) ja herefordin HY (hypotrikoosi). Automatiikka tuo  tuloksia näkyviin eläinten tietoihin uusien analysointien valmistumisen tahdissa viikosta 2 eteenpäin. Alustavien manuaalisten tarkastelujen mukaan kaikki vaikuttaa hyvältä. Tulokset ovat nähtävissä Minun Maatilani –palvelun tai kantakirjatodistuksen kautta.
Tilaa genomitesti MinunMaatilani.fi -sovelluksen kautta.
Seuraavassa vaiheessa tuloksia haetaan takautuvasti jo aikaisemmin testatuille eläimille ja tulokset tallennetaan eläinten tietoihin. DD ja HY tulivat uusina ominaisuuksina genomitestisirulle, joka on otettu käyttöön loka-marraskuussa 2020. Tuloksia voidaan siis hakea takautuvasti niille eläimille, jotka on genomitestattu loka-marraskuun 2020 jälkeen. Tulosten takautuva haku ja tallennus pyritään suorittamaan mahdollisimman pian, mutta tulosten suuresta määrästä johtuen  pyydämme kärsivällisyyttä.
Lisätietoja DDstä ja HYstä löytyy  <a href="https://wordpress.faba.fi/fi/karjan-hyvinvointi/dna-maaritykset/lihakarjan-dna-maaritykset/">Faban kotisivuilta liharotujen DNA-määrityksien selvityksestä.</a>
&nbsp;
Tulokset tallennetaan tietokantaan seuraavasti:
DD (Developmental Duplication) 
DDF = vapaa DDC = heterotsygootti kantaja DDS = homotsygootti kantaja eli sairas
HY (Hypotrikoosi) 
HYF = vapaa HYC = heterotsygootti kantaja HYS = homotsygootti kantaja eli sairas
&nbsp;
Hyödylliset linkit:
<a href="https://wordpress.faba.fi/fi/karjan-kehittaminen/genomitestaus/">Genomitestaus, MM.fin näyteseuranta</a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/fi/karjan-hyvinvointi/dna-maaritykset/lihakarjan-dna-maaritykset/">Oirekuvaukset, testaustiedot</a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/fi/karjan-hyvinvointi/dna-maaritykset/nautojen-perinnolliset-sairaudet/">Lisätiedot, tuloskoodit</a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/wp-content/uploads/2022/08/Genomitestitilauksen-tekeminen-MM.fissä_Asiakasohje.pdf" target="_blank" rel="noopener">Genomitestitilauksen tekeminen MM.fi </a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/wp-content/uploads/2022/08/Tilausohjelman-käyttöönotto-MM.fissä_Asiakasohje.pdf" target="_blank" rel="noopener">Genomitestitialusohjelman käyttöönotto</a>
Lisätietoja 
Fabalab, <a href="mailto:fabalab@faba.fi">fabalab@faba.fi</a>

Aihe: hereford

Artikkelit