Herefordilta löydettiin uusi tautigeeni marraskuussa 2023, kun Amerikan Hereford -yhdistyksen jäsenet raportoivat vasikoista, jotka olivat syntyneet terveinä, mutta sokeutuneet myöhemmin. Sairailla eläimillä näkökyvyn heikentyminen on havaittu noin 9-12 kuukauden iässä. Amerikan Hereford -yhdistys on listannut tunnettuja kantajia ja sairaita eläimiä kotisivuillaan.
Oireiden taustalla todettiin olevan Delayed Blindness -tautigeeni, joka aiheutuu mutaatiosta CLN3-geenissä. Tautigeeni periytyy resessiivisesti eli geenivirhe tulee periä molemmilta vanhemmilta, jotta sairaus ilmenee. Tautigeeni aiheuttaa verkkokalvorappeumaa ja siitä aiheutuvaa etenevää sokeutumista. Verkkokalvorappeumaa ei voi nähdä ulospäin, joten päällisin puolin silmä näyttää normaalilta. Sairaus muistuttaa oireiltaan muilla roduilla tavattavaa RP1-tautigeeniä, mutta kyseessä on kaksi erillistä tautigeeniä.
Delayed Blindness ja se mahdolliset kantajat on mahdollista määrittää erillisellä DNA-testillä. Määritystä ei voi tilata genomitestinäytteestä, vaan määritykseen tarvitaan oma erillinen näyte. Testin hinta on 36 € + alv. Määritys kestää noin 4-5 viikkoa. Määritys on mahdollinen kaikilla näytetyypeillä, mutta karva- ja verinäytteiden ottamiseen tulee käyttää laboratorion omia tarvikkeita.
Delayd Blindnessin tuloskoodit ovat: 
DBF (vapaa)   DBC (heterotsygootti kantaja)   DBS (homotsygootti kantaja)
&nbsp;
Lisätietoja ja näytteenottotarvikkeiden tilaukset: fabalab@faba.fi
Fabalab-palvelut 
fabalab@faba.fi 
puh. 043 825 1003

Genomitestitilauksia ja genominäytteiden analysointia on mahdollista seurata Minun Maatilani -palvelussa näyteseurannan kautta. Näyteseuranta on osa muokattavia raportteja eli se on käytössä kaikille Minun Maatilani -käyttäjille, joilla on Maito Pro, Emo Pro tai Liha Pro -paketti käytössään. Ohjeet näyteseurannan ja isyystarkisteen käyttöönottoon ja tulkintaan löytyvät <a href="http://www.faba.fi/fi/genomitestaus">täältä.</a>
Valittavissa on kolme saraketta, joista on aiemmin ollut käytössä vain kaksi ensimmäistä, &#8220;DNA-tulos&#8221; ja &#8220;Genomitestaus&#8221;. Nyt osioon kuuluva kolmas sarake on otettu käyttöön! Sarakkeen uusi otsikko on &#8220;Seurantapäivä&#8221;. Jatkossa tämän sarakkeen kautta voi tarkastella&#8221;Genomitestaus&#8221;-sarakkeessa näkyvän näytestatuksen viimeisintä muokkausaikaa. Kyseinen päivämäärä päivittyy aina, kun eläimen näytestatus päivittyy. Päivämäärän avulla on helppo esimerkiksi arvioida eläimen genomituloksen laskenta-ajankohta.
&nbsp;
<img loading="lazy" decoding="async" class="alignnone size-full wp-image-390823" src="https://wordpress.faba.fi/wp-content/uploads/2024/06/Nayteseuranta_Seurantapv.png" alt="" width="900" height="528" />
&nbsp;
Yksittäisissä poikkeustapauksissa eläimen näytestatusta voidaan joutua muokkaamaan manuaalisesti ja tällöin päivämäärä voi olla poikkeava. Näissä tapauksissa seuranta jatkuu normaalisti jälleen seuraavasta näytestatuksen päivityksestä eteenpäin.
Genomitestaukseen ja näyteseurantaan liittyvissä kysymyksissä voi ottaa yhteyttä Fabalab-palveluihin.
&nbsp;
Fabalab-palvelut 
fabalab@faba.fi 
puh. 043 825 1003

Kantakirjaohjeistus on muuttunut niin, että jatkossa 1.1.2024 jälkeen syntyneiltä sonneilta vaaditaan genotyypitys ennen kantakirjausta. Tämä tarkoittaa sitä, että sonnista on lähetetty DNA-näyte (kudos, karva, veri) Fabalabiin. Helpointa on käyttää DNA-korvamerkkejä, mutta karva-, TEGO- tai verinäyte toimivat myös. DNA-näyte lähetetään Fabalabiin. Genotyypitys maksaa vajaa 30 euroa (alv 0%). Samalla näytteellä genomiset jalostusarvot saavat vain Ab, Ch, Hf, Li ja Si-rotujen sonnit, jotka kuuluvat emolehmätarkkailuun tai karjaan, joka on hankkinut FabaIndeksi-palvelun käyttöönsä.
Sonnin polveutuminen varmistuu, jos sonnin isän ja/tai emän genotyypitystiedot löytyvät tietokannasta. Joskus genotyypityksen yhteydessä saatetaan havaita ristiriitaisuuksia Nautarekisteriin ilmoitettujen vanhempien sopivuuteen. Niissä tapauksissa, joissa eläimen emä vahvistuu genotyypitystietojen perusteella ja isätieto on ristiriitainen. Kuitenkin tietokannasta löytyvien snp-tietojen perusteella voidaan vahvistaa joku toinen isyys, Fabalab muuttaa isätiedon Nautarekisteriin. Muissa tapauksissa Fabalab ottaa yhteyttä eläimen omistajaan.
Tämän muutoksen myötä siirrytään vaiheittain sellaiseen tilanteeseen, jossa kaikilta kantakirjatuilta sonneilta on genotyypitystiedot polveutumistietokannassa. Jolloin näitä tietoja voidaan käyttää sonnien jälkeläisten isyyksien varmistamiseen.  Muutoksen tavoitteena on vähentää virheellisten tai puutteellisten polveutumisten määrää, mikä on hyvin keskeinen perusta koko jalostustyölle.
Nyt kannattaa ottaa kevään sonnivasikoista genotyypitysnäytteet ja lähettää Fabalabiin.
Lisätietoja:
Eläinaineksen asiantuntijat: katso yhteystiedot <a href="http://www.faba.fi/fi/yhteystiedot">www.faba.fi/fi/yhteystiedot</a>
Fabalab, <a href="mailto:fabalab@faba.fi">fabalab@faba.fi</a>
Pirkko Taurén, <a href="mailto:pirkko.tauren@faba.fi">pirkko.tauren@faba.fi</a>
&nbsp;

Genomitestin yhteyteen on liitetty jälleen uusia tautigeenimäärityksiä. Uusina genomitestauksen yhteydessä automaattisesti julkaistaviin tuloksiin on maalis-huhtikuun vaihteessa liitetty BLIRD (holstein), JNS (jersey), PR eli protoporfyria (limousin ja blonde A&#8217;quitaine) ja TP eli trombopatia (simmental). Tuloksia on julkaistu takautuvasti jo aikaisemmin genomitestatuille eläimille. Tuloksia pääsee tarkastelemaan Minun Maatilani -palvelun kautta.
Trombopatia- ja protoporfyria-tulosten julkaisu aloitettiin simmental ja limousin roduille jo lihakarjan genomihankkeen aikana. Tuolloin julkaisu tapahtui erillisjärjestelyiden kautta indeksilaskentojen yhteydessä. Jatkossa nämä tulokset julkaistaan automaattisen julkaisun kautta samaan aikaan muiden DNA-tulosten kanssa. Blondeille protoporfyria-tuloksia julkaistaan nyt ensimmäistä kertaa.
&nbsp;
Lisätietoja tautigeeneistä:
&nbsp;
BLIRD (Bovine Lymphocyte Intestinal Retention Defect)
<ul>
<li>BLIRD on holsteinilla esiintyvä resessiivinen tautigeeni, joka heikentää ruuansulatuselimistön immuunipuolustusta. Sairaat vasikat ovat alttiimpia suolistotulehduksille ja loisille. Sairaiden vasikoiden kasvu on noin 27 % keskimääräistä heikompaa ja niiden kuolleisuus / karsinta vasikkana on 10 % keskimääräistä yleisempää.</li>
<li>BLIRD:n kantajien osuus testatuista eläimistä on tällä hetkellä 7,8 %. Sairaiksi on todettu 0,16 % testatuista eläimistä. Sairaiksi todettujen eläinten omistajiin tullaan ottamaan erikseen yhteyttä.</li>
<li>Tuloslyhenteet: LRF (vapaa)/ LRC (kantaja)/ LRS (homotsygootti kantaja, sairas)</li>
</ul>
&nbsp;
JNS (Jersey Neuropathy with Splayed Forelimbs)
<ul>
<li>JNS on jerseyllä esiintyvä resessiivinen tautigeeni. Sairaat vasikat syntyvät elossa ja näyttävät terveiltä, mutta niillä esiintyy neurologisia ongelmia, lihasjäykkyyttä pään ja niskan alueella sekä eturaajojen jäykkyyttä ja tunnottomuutta. Vasikat eivät yleensä pysty seisomaan ja ne on lopetettava.</li>
<li>Tuloslyhenteet: JNSF (vapaa)/ JNSC (kantaja)/ JNSS (homotsygootti kantaja, sairas)</li>
</ul>
&nbsp;
TP (Trombopatia)
<ul>
<li>Trombopatia on simmentalilla esiintyvä resessiivinen tautigeeni, joka aiheuttaa häiriöitä veren hyytymistekijöihin.</li>
<li>Tuloslyhenteet: TPF (vapaa)/ TPC (kantaja)/ TPS (homotsygootti kantaja, sairas)</li>
</ul>
&nbsp;
PR (Protoporfyria)
<ul>
<li>Protoporfyria on limousin ja blonde d&#8217;Aquitaine roduilla esiintyvä resessiivinen tautigeeni, joka aiheuttaa valoyliherkkyyttä. Sairaat eläimet usein välttevät suoraa auringonpaistetta ja niillä voi ilmetä karvattomuutta, haavaumia tai ihottumaa etenkin kohdissa, joissa karvapeite on ohut (selkä, turpa).</li>
<li>Tuloslyhenteet: PRF (vapaa)/ PRC (kantaja)/ PRS (homotsygootti kantaja, sairas)</li>
</ul>
&nbsp;
Tulokset tullaan lisäämään mahdollisimman pian myös tautigeenien rotukohtaiseen tilastoon. Tilastoja pääsee tarkastelemaan <a href="http://www.faba.fi/fi/nautojen-perinnolliset-sairaudet">tästä</a>.
&nbsp;
Genomitestaukseen ja tautigeeneihin liittyvissä kysymyksissä voi ottaa yhteyttä Fabalab-palveluihin.
Fabalab-palvelut 
fabalab@faba.fi 
puh. 043 825 1003

Geno24-genomitestituki on Faban lanseeraama tuki, jolla tuetaan genomitestausta vuoden 2024 aikana. Tukea voivat hakea sekä lypsy- että emolehmätilat. Tukea rahoitetaan Maa- ja metsätalousministeriön yleisavustuksella. Tuen myöntämisen edellytyksenä on allekirjoitettu tuensaajan ilmoitus, jolla tilallinen vakuuttaa annetut tilan tiedot paikkansapitäviksi. Tukea ei voida myöntää takautuvasti jo laskutetuille näytteille.
Tukea myönnetään lähetettyjen näytteiden mukaisesti ja se huomioidaan laskutuksessa eläinkohtaisina hyvitysriveinä. Näytteet tulee toimittaa Fabalab-palveluihin vuoden 2024 aikana. Tuen suuruus vuonna 2024 on:
Lypsyrodut (AY, HOL, JER, LSK): 
7,5 € (alv 0 %) / näyte
Liharodut (AAN, CHA, HER, LIM, SIM): 
15 € (alv 0 %) / näyte
Tuen näytekiintiöt ovat lypsykarjalle 12 000 näytettä ja lihakarjalle 5000 näytettä. Tukea maksetaan vuoden loppuun tai niin kauan kuin näytekiintiötä on jäljellä. Faba pidättää oikeuden muuttaa näytekiintiöiden suhdetta, mikäli tuotantosuuntakohtainen kiintiö ei täyty.
&nbsp;
Tila- ja eläinkohtaiset kriteerit Geno24-genomitestituen hakemiseksi
Lypsyrodut:
<ul>
<li>Tuensaajan ilmoitus koskien tilan tietoja on palautettu allekirjoitettuna.</li>
<li>Tilan tulee kuulua tuotosseurantaan.</li>
<li>Eläimen, isän ja emänisän tulee olla samaa rotua.</li>
</ul>
Liharodut:
<ul>
<li>Tuensaajan ilmoitus koskien tilan tietoja on palautettu allekirjoitettuna.</li>
<li>Tilan tulee kuulua emolehmätarkkailuun tai FabaIndeksi-palveluun.</li>
<li>Eläimen ja sen vanhempien tulee olla jotakin mainituista roduista.</li>
</ul>
Geno24-genomitestitukea ei voida myöntää yrityksille, jotka ovat vakavissa vaikeuksissa tai joilta ollaan perimässä takaisin sääntöjen vastaista ja sisämarkkinoille soveltumatonta tukea. Lisätiedot tuensaajan ilmoituksen liitteenä.
Geno24-genomitestitukea voi hakea täyttämällä hakulomakkeen alla olevan linkin kautta. Hakulomakkeen täyttämisen jälkeen hakijalle toimitetaan sähköpostilla ohjeet tuensaajan ilmoituksen sähköistä allekirjoittamista varten noin viikon kuluessa.
<a href="https://bit.ly/geno24-genomitestituki">Hae Geno24-genomitestitukea tästä.</a>
&nbsp;
Lisätietoja
Genomitestaaminen: <a href="http://www.faba.fi/fi/genomitestaus">www.faba.fi/fi/genomitestaus</a> 
Pirkko Taurén, pirkko.tauren@faba.fi / Geno24-genomitestituki yleisesti 
Fabalab-palvelut, fabalab@faba.fi / Tuen hakeminen, genomitestien tilaaminen, laskutus

<h3>Lypsykarjan jalostuksessa on jo pitkään hyödynnetty genomitestaamista varmistamaan terve ja ominaisuuksiltaan paras eläinaines. Nyt sama genominen aikakausi koitti myös lihakarjalle.</h3>
Genomitestaamalla varmistuu eläimen polveutuminen, selviää perinnölliset sairaudet samoin kuin se, onko eläin sarvellinen tai nupouden suhteen heterotsygootti vai homotsygootti? Sen lisäksi, että genomiarvostelu lisää nuorten eläinten jalostusarvojen arvosteluvarmuutta, se parantaa myös tilan taloutta. Genomisten arvosteluiden myötä eläinten karsintaa voidaan tehdä jo aikaisemmassa vaiheessa ja epäonnistuneita eläinvalintoja tapahtuu yhä harvemmin. Genomitestaamalla selviää myös iso joukko perinnöllisten sairauksien tuloksia. Perinnöllisen sairauden kantaja jättää sairausgeeniä puolelle jälkeläisistään, joten on erittäin viisasta selvittää jalostukseen käytettävien eläinten geenit nyt, eikä myöhemmin.
Jatkossa lihakarjan jalostusarvostelu hyödyntää kaikkia saatavilla olevia tietoja samassa laskennassa. Mikäli eläimen jalostusarvolaskennassa on hyödynnetty sen omaa genomitestaustietoa, näkyy eläimen indeksien kohdalla jatkossa merkintä ’G’ useissa eri listauksissa mm. Minun Maatilani -ohjelmistossa.
Genomiaikaan siirtyminen muuttaa myös indeksien julkaistavuuden määrittelyä. Indeksin luotettavuuden paras mittari on arvosteluvarmuus, joka vaihtelee 0 &#8211; 100 %. Genomitieto parantaa indeksin luotettavuutta nopeasti. Uudistuvassa genomiarvostelussa kaikkien laskennassa olevien eläinten indeksit julkaistaan, mikäli arvosteluvarmuus on vähintään 35 %. Tämä koskee siis kaikkia liharotuisten eläinten indeksejä.
Genomiarvostelu on tutkitusti tehokkain työkalu eläinvalintojen onnistumisessa. Lihakarjan jalostusarvostelu siirtyi genomiaikaan 20.3.2023 alkaneessa arvostelussa. Jalostusarvot on päivitetty tietokantaan 24.3.2023.
Lisätietoja:
Kaisa Sirkko, puh. 0400 614 084 tai kaisa.sirkko@faba.fi 
Pirkko Taurén, puh. 0400 614 074 tai pirkko.tauren@faba.fi
&nbsp;

<div class="x1e56ztr">
Faba on yhteistyökumppanina Helsingin yliopiston AGRI-021 projektikurssilla aiheella &#8220;RP1-tautigeenin ilmeneminen charolais-rodulla&#8221;.
Työn tavoitteena on kartoittaa RP1-tautigeenin (nk. Blind) sekä erilaisten näkökykyyn liittyvien oireiden ilmentymistä charolais-rodulla. Aikaisemmin aihetta on tutkittu LSK-rodulla. Lisäksi työssä selvitetään tilallisten mielipiteitä ja ajatuksia naudan näkökyvyn merkitykseen ja DNA-testaukseen liittyen. Selvitys koostuu kahdesta osasta, sähköisestä kyselytutkimuksesta ja puhelimitse tehtävästä haastattelututkimuksesta.
Kyselytutkimus on avattu 20.2.2023 ja se on avoinna sunnuntaihin 5.3.2023 asti. Kyselytutkimukseen pääsee alla olevasta linkistä. Lisäksi kutsu kyselytutkimukseen on toimitettu sähköpostilla niille tiloille, joilla rekisteritietojen mukaan on tällä hetkellä / on ollut useita charolais-rotuisia eläimiä (emän ja isän rotu CHA) karjassaan.
</div>
<div></div>
<div class="x1e56ztr">Linkki kyselyyn: 
<a class="x1i10hfl xjbqb8w x6umtig x1b1mbwd xaqea5y xav7gou x9f619 x1ypdohk xt0psk2 xe8uvvx xdj266r x11i5rnm xat24cr x1mh8g0r xexx8yu x4uap5 x18d9i69 xkhd6sd x16tdsg8 x1hl2dhg xggy1nq x1a2a7pz xt0b8zv x1fey0fg" tabindex="0" role="link" href="https://q.surveypal.com/RP1-kysely?fbclid=IwAR2l3GBG-L9DPEJPnbyW2UjF2XPw-QwYszgLSNdMe2kAUyYTg8ClDf5zvis" target="_blank" rel="nofollow noopener">https://q.surveypal.com/RP1-kysely</a></div>
<div></div>
<div class="x1e56ztr"> 
Kyselytutkimuksen teknisestä toteutuksesta vastaa Faba osk. Kaikkien vastanneiden kesken arvotaan 3 genomitestilahjakorttia!</div>
<div class="x1e56ztr"> 
Puhelinhaastattelujen puitteissa tullaan ottamaan yhteyttä tiloihin, joilla on tällä hetkellä / on ollut karjassaan eläimiä, jotka on DNA-testillä todettu RP1-tautigeenin suhteen homotsygootti kantajiksi eli sairaiksi (tuloskoodi RP1S). Haastattelussa kartoitetaan tarkemmin tunnettujen sairaiden mahdollista oirekuvaa ja oireiden etenemistä.</div>
<div class="x1e56ztr"> 
Kiitos vastauksistanne jo etukäteen!Lisätiedot ja kysymykset: 
Sonja Närkki / sonja.narkki@faba.fi<a href="http://www.faba.fi/fi/lihakarjan-dna-maaritykset">Lisätietoja RP1-tautigeenistä.</a>
</div>

Genomitestin yhteydessä automaattisesti julkaistaviin tuloksiin on joulukuussa 2022 lisätty herefordin MD (Mandibulofacial Dysostosis) ja tammikuussa 2023 herefordin MSUD (Maple Syrup Urine Disease). Tulokset julkaistaan automaattisesti genomitestauksen yhteydessä. Tulokset ovat nähtävissä Minun Maatilani –palvelun tai kantakirjatodistuksen kautta.
<a href="http://www.faba.fi/fi/genomitestaus">Genomitestin</a> pääset tilaamaan MinunMaatilani.fi -palvelun kautta.
Tuloksia on tallennettu takautuvasti myös aikaisemmin testatuille eläimille. MSUD on ollut genomitestisirulla pitkään, joten tuloksia on saatu lähes kaikille tähän mennessä genomitestatuille hereford-eläimille. MD saatiin uutena ominaisuutena nykyiselle genomitestisirulle. Nykyinen genomitestisiru on otettu käyttöön joulukuussa 2021, joten käytännössä takautuva tuloksia saatiin vain vuoden 2022 aikana genomitestatuille eläimille.
Lisätietoja oireista löytyy <a href="http://www.faba.fi/fi/lihakarjan-dna-maaritykset">Lihakarjan DNA-määritykset -sivulta.</a>
&nbsp;
Tulokset tallennetaan tietokantaan seuraavasti:
MD (Mandibulofacial Dysostosis) 
MDF = vapaa      MDC = heterotsygootti kantaja      MDS = homotsygootti kantaja eli sairas
MSUD (Maple Syrup Urine Disease) 
MSU1F = vapaa      MSU1C = heterotsygootti kantaja      MSU1S = homotsygootti kantaja eli sairas
<div>
<div></div>
<div>HUOM! MSUD:n tuloskoodit on päivitetty vuodenvaihteessa 2022-2023.</div>
<div>Sairautta tavataan myös shorthorn-rodulla, joten tuloskoodit on eroteltu seuraavasti:</div>
<div>1 = Hereford</div>
<div>2 = Shorthorn</div>
</div>
&nbsp;
Hyödylliset linkit:
<a href="https://wordpress.faba.fi/fi/karjan-kehittaminen/genomitestaus/">Genomitestaus, MM.fin näyteseuranta</a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/fi/karjan-hyvinvointi/dna-maaritykset/lihakarjan-dna-maaritykset/">Oirekuvaukset, testaustiedot</a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/fi/karjan-hyvinvointi/dna-maaritykset/nautojen-perinnolliset-sairaudet/">Lisätiedot, tuloskoodit</a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/wp-content/uploads/2022/08/Genomitestitilauksen-tekeminen-MM.fissä_Asiakasohje.pdf" target="_blank" rel="noopener">Genomitestitilauksen tekeminen MM.fi </a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/wp-content/uploads/2022/08/Tilausohjelman-käyttöönotto-MM.fissä_Asiakasohje.pdf" target="_blank" rel="noopener">Genomitestitialusohjelman käyttöönotto</a>
Lisätietoja 
Fabalab, <a href="mailto:fabalab@faba.fi">fabalab@faba.fi</a>

<h3>Liharotujen genomitestaus </h3>
Liharotujen ensimmäinen genomiarvostelun tulokset julkaistaan vuoden 2023 ensimmäisen arvostelun yhteydessä maaliskuussa. Tässä tiedotteessa on tiivistelmä genomiarvostelutilanteen tämän hetkisestä tilanteesta.
Tilaa tulevalla poikimakaudella syntyville vasikoille DNA-korvamerkit, niin genomitestaus onnistuu helpoiten.
Genomitestillä voidaan määrittää eläimen jalostusarvo DNA:n avulla. Genomi-indeksit kertovat jo vasikkana millaisia geenejä eläin tulee jättämään jälkeläisilleen. Näin vauhditetaan karjan tavoitteiden toteutumista! 
<h3>Genomitestin hinta (lihakarja) </h3>
<ul>
<li data-leveltext="" data-font="Symbol" data-listid="16" data-list-defn-props="{&quot;335552541&quot;:1,&quot;335559684&quot;:-2,&quot;335559685&quot;:720,&quot;335559991&quot;:360,&quot;469769226&quot;:&quot;Symbol&quot;,&quot;469769242&quot;:[8226],&quot;469777803&quot;:&quot;left&quot;,&quot;469777804&quot;:&quot;&quot;,&quot;469777815&quot;:&quot;hybridMultilevel&quot;}" data-aria-posinset="1" data-aria-level="1">Kaikki näytetyypit 24,30 e / näyte + alv  </li>
</ul>
  Laskurivit muodostuvat, kun näyte toimitetaan analysoitavaksi. Laskut toimitetaan asiakkaille kuun vaihteessa.   
<h3>Genomitestien tilaaminen   </h3>
Genomitestejä pääsee tilaamaan Minun Maatilani -palvelun kautta. Ohjeet tilausohjelman käyttöönottoon ja käyttöön löytyvät Faban kotisivuilta: Karjan kehittäminen &gt; Genomitestaus. Tilausten tekeminen ennen näytteiden lähettämistä nopeuttaa näytteiden käsittelyä huomattavasti. 
Allflexin DNA-korvamerkit tilausohjelma tunnistaa automaattisesti. Jos käytössä on AgroTag Genomerkit, voi näytetyypin vaihtaa kudosnäytteeksi näytetyyppivalikon kautta.    
<h3>DNA-korvamerkit   </h3>
Näytteenotto sujuu helpoiten DNA-korvamerkeillä. HUOM! DNA-korvamerkkeihin ei automaattisesti sisälly genomitestitilausta. Näytteitä ei käsitellä, jos niille ei ole tehty genomitestitilausta. Näytteiden jouhevan käsittelyn takaamiseksi on tärkeää tarkistaa genomitestitilaukset ja mahdolliset poistettavat näytteet ennen näytteiden lähettämistä.   
<h3>Näyteseuranta Minun Maatilani -palvelussa   </h3>
Genomitestien etenemistä voi seurata aina tilauksesta tuloksiin Minun Maatilani -palvelun kautta. Näyteseuranta -toiminto on osa muokattavia raportteja. Ohjeet näyteseurannan käyttöönottoon ja tulkintaan löytyvät Faban kotisivuilta: Karjan kehittäminen &gt; Genomitestaus.  
<h3>Genomiset jalostusarvot  </h3>
Ensimmäiset genomiset jalostusarvot julkaistaan vuoden 2023 ensimmäisen liharotujen arvostelun yhteydessä. Laskenta alkaa 20.3.2023 maanantaina. Jotta eläin on mukana laskennassa, DNA-näytteen pitää olla toimitettu Fabalabiin viimeistään 20.1.2023 mennessä. Genomiset jalostusarvot lasketaan seuraaville roduille: aberdeen angus, hereford, charolais, limousin ja simmental. 
Koko liharotujen jalostusarvojen laskentajärjestelmä uudistuu siten, että siirrytään käyttämään ns. monen rodun single-step-mallia. Kaikki informaatio on laskennassa samalla kertaa mukana ja myös ensimmäisen polven risteytykset tulevat saamaan jalostusarvot. 
<h3>Genomitestin yhteydessä automaattisesti julkaistavat DNA-tulokset tautigeeneistä ja perinnöllisistä ominaisuuksista  </h3>
Genomitestauksen yhteydessä julkaistaan automaattisesti useita DNA-tuloksia tautigeenien ja perinnöllisten ominaisuuksien suhteen. Tutkittava eläin tarkistetaan kaikkien saatavilla olevien testien suhteen, mutta tulosten julkaisussa käytetään roturajoitteita, jotta tulosjoukko pysyy luettavana. Rodulle tärkeiden tulosten lisäksi kaikki tautigeenien kantaja-tulokset julkaistaan rodusta riippumatta. Tulokset näkyvät Minun Maatilani -palvelussa näyteseurannan ja eläimen eläinkortin kautta. Ajantasainen lista automaattisesti julkaistavista tuloksista löytyy Faban kotisivuilta: Karjan kehittäminen &gt; Genomitestaus. Tällä hetkellä julkaistavia tuloksia ovat:

<table data-tablestyle="MsoTableGrid" data-tablelook="1184">
<tbody>
<tr>
<td data-celllook="4369">Automaattisesti julkaistavat DNA-tulokset </td>
<td data-celllook="4352">AAN </td>
<td data-celllook="0">CHA </td>
<td data-celllook="0">HER </td>
<td data-celllook="0">LIM </td>
<td data-celllook="0">SIM </td>
</tr>
<tr>
<td data-celllook="1">Ataksia </td>
<td data-celllook="1"> </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
</tr>
<tr>
<td data-celllook="0">Brown Swiss Haplotype 2, BH2 </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
</tr>
<tr>
<td data-celllook="0">Developmental Duplication, DD </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
</tr>
<tr>
<td data-celllook="0">Hypotrikoosi, HY </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
</tr>
<tr>
<td data-celllook="0">Mandibulofacial Dysostosis, MD    *UUTTA 11/2022* </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0"> </td>
<td data-celllook="0"> </td>
</tr>
<tr>
<td data-celllook="0">Nupous </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
</tr>
<tr>
<td data-celllook="0">Retinitis Pigmentosa 1, RP1 </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
<td data-celllook="0">Kyllä </td>
</tr>
</tbody>
</table>

<h3>Polveutumisen vahvistuminen / SNP-polveutumismääritys  </h3>
Eläimen polveutuminen tarkistetaan genomitestin yhteydessä automaattisesti, jos emä ja/tai isä on jo aiemmin genomitestattu. Sopivia sukulaisia etsitään kaikkien genomitestattujen eläinten joukosta. Mikäli DNA-tulosten ja rekisteriin merkittyjen polveutumistietojen välillä havaitaan ristiriitaa, eläin saa ”ilmennyt epäselvyys” -merkinnän. Fabalab käsittelee merkinnän saaneiden eläinten eli nk. virhelistan tietoja automaattisesti ja ottaa tilaan yhteyttä. Jos emä on genomitestattu ja emäksi vahvistunut ja isätiedon suhteen havaitaan ristiriitaa, isätiedon muutos käsitellään automaattisesti ilman erillistä yhteydenottoa. Tila saa tehdystä isätiedon muutoksesta automaattisen ilmoituksen sähköpostilla.  
SNP-polveutumismääritys perustuu genomitestaukseen eli määrityksen yhteydessä eläimelle julkaistaan kaikki samat DNA-tulokset kuin genomitestauksen yhteydessä. SNP-polveutumismäärityksen ja genomitestauksen ero tulee tavasta, jolla Fabalab käsittelee näytteitä ja tuloksia. SNP-polveutumismäärityksen tilaamista suositellaan, jos polveutumistiedoissa epäillään virhettä, eläimen isä ja/tai emä genomitestataan samaan aikaan jälkeläisen kanssa tai eläin ei täytä genomitestauksen kriteereitä. Lisätiedot ja tilaukset: fabalab@faba.fi.  
<div class="blog-share text-center">
<div class="is-divider medium"></div>
</div>

Genomitestin yhteydessä automaattisesti julkaistaviin tuloksiin on viikolla 1 lisätty anguksen DD (Developmental Duplication) ja herefordin HY (hypotrikoosi). Automatiikka tuo  tuloksia näkyviin eläinten tietoihin uusien analysointien valmistumisen tahdissa viikosta 2 eteenpäin. Alustavien manuaalisten tarkastelujen mukaan kaikki vaikuttaa hyvältä. Tulokset ovat nähtävissä Minun Maatilani –palvelun tai kantakirjatodistuksen kautta.
Tilaa genomitesti MinunMaatilani.fi -sovelluksen kautta.
Seuraavassa vaiheessa tuloksia haetaan takautuvasti jo aikaisemmin testatuille eläimille ja tulokset tallennetaan eläinten tietoihin. DD ja HY tulivat uusina ominaisuuksina genomitestisirulle, joka on otettu käyttöön loka-marraskuussa 2020. Tuloksia voidaan siis hakea takautuvasti niille eläimille, jotka on genomitestattu loka-marraskuun 2020 jälkeen. Tulosten takautuva haku ja tallennus pyritään suorittamaan mahdollisimman pian, mutta tulosten suuresta määrästä johtuen  pyydämme kärsivällisyyttä.
Lisätietoja DDstä ja HYstä löytyy  <a href="https://wordpress.faba.fi/fi/karjan-hyvinvointi/dna-maaritykset/lihakarjan-dna-maaritykset/">Faban kotisivuilta liharotujen DNA-määrityksien selvityksestä.</a>
&nbsp;
Tulokset tallennetaan tietokantaan seuraavasti:
DD (Developmental Duplication) 
DDF = vapaa DDC = heterotsygootti kantaja DDS = homotsygootti kantaja eli sairas
HY (Hypotrikoosi) 
HYF = vapaa HYC = heterotsygootti kantaja HYS = homotsygootti kantaja eli sairas
&nbsp;
Hyödylliset linkit:
<a href="https://wordpress.faba.fi/fi/karjan-kehittaminen/genomitestaus/">Genomitestaus, MM.fin näyteseuranta</a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/fi/karjan-hyvinvointi/dna-maaritykset/lihakarjan-dna-maaritykset/">Oirekuvaukset, testaustiedot</a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/fi/karjan-hyvinvointi/dna-maaritykset/nautojen-perinnolliset-sairaudet/">Lisätiedot, tuloskoodit</a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/wp-content/uploads/2022/08/Genomitestitilauksen-tekeminen-MM.fissä_Asiakasohje.pdf" target="_blank" rel="noopener">Genomitestitilauksen tekeminen MM.fi </a>
<a href="https://wordpress.faba.fi/wp-content/uploads/2022/08/Tilausohjelman-käyttöönotto-MM.fissä_Asiakasohje.pdf" target="_blank" rel="noopener">Genomitestitialusohjelman käyttöönotto</a>
Lisätietoja 
Fabalab, <a href="mailto:fabalab@faba.fi">fabalab@faba.fi</a>

Aihe: genomitesti

Artikkelit