Lihakarjan DNA-määritykset

Lihakarjalle on saatavissa alla olevat DNA-määritykset. Tutkimus kestää määrityksestä riippuen 4 – 8 viikkoa. Yksittäisten DNA-testien tulokset ilmoitetaan kirjallisesti tilaajan valinnan mukaan joko sähköpostilla tai kirjeenä. Genomitestin yhteydessä saatavat DNA-tulokset julkaistaan Minun Maatilani -palvelussa ilman erillistä ilmoitusta. Näytteenottotarvikkeet sisältävän määrityspaketin voi tilata Fabalabista sähköpostilla tai puhelimitse. Lisätietoja genomitestauksesta ja genomitestin tilaamisesta löytyy täältä.

Tältä sivulta löydät oirekuvaukset ja tietoa DNA-testauksesta. Lisätietoja testattavien sairauksien ja ominaisuuksien taustoista, sekä periytymisen perusteista voit lukea täältä.

Lisätietoja ja tarkemmat tautikuvaukset löydät NAV.n kotisivuilta.

  • AED
  • AM (nk. Curly Calf)
  • Ataksia eli PA
  • BH2
  • Blind eli RP1
  • CA
  • CL16
  • DD
  • Hypotrikoosi
  • IARS
  • Kitalakihalkio
  • Mannosidoosi
  • MD
  • MH (Culard)
  • MSUD
  • NH
  • Nupous
  • Protoporfyria
  • Red factor
  • Trombopatia
  • Wa-testipaketti (B3, CHS, F11, F13)

AED (Anhidrotic Ectodermal Dysplasia)

Esittelyteksti tulossa.

Tutkimus onnistuu vain kudosnäytteestä, joka on otettu laboratorion omilla näytteenottovälineillä. Kudosnäytteen voi poikkeuksellisesti ottaa ilman korvamerkin kiinnittämistä. Tutkimus on osa ataksia-testipakettia, jonka yhteydessä saadaan seuraavat tulokset: ataksia, blind, AED, MH ja nupous. Määritys kestää 4-5 viikkoa. Määritys tehdään erillisessä laboratoriossa, joten määritystä ei voi tilata genomitestinäytteestä.

AM (nk. Curly Calf, Arthrogryposis Multiplex)

AM, toiselta nimeltään Curly calf-syndrooma, on esimerkiksi anguksella esiintyvä letaali eli kuolemaan johtava geenivirhe, joka aiheuttaa luuston kehityshäiröitä. AM periytyy resessiivisesti. Sairaat vasikat syntyvät tavallisesti kuolleina ja niillä on nimen mukaisesti kiertynyt selkäranka sekä suurentuneet ja jäykistyneet raajat. Tutkimus onnistuu Allflexin DNA-korvamerkeillä otetulla kudosnäytteellä tai laboratorion omille näytelapuille otetulla karvanäytteellä. Tutkimus kestää 4-8 viikkoa. Määritys tehdään erillisessä laboratoriossa, joten määritystä ei voi tilata genomitestinäytteestä.

Ataksia eli PA (Progressive Ataxia)

Ataksia on charolaisilla esiintyvä resessiivisesti periytyvä hermostosairaus. Ensimmäiset oireet ilmenevät yleensä eläimen ollessa 8-24 kk ikäinen. Tyypillisiä oireita ovat eläimen heikkous ja ataksia eli häiriöt liikkeiden koordinaatiossa. Ataksiaa havaitaan tavallisesti etenkin takajaloissa. Alkuvaiheessa eläimen on vaikea kävellä ja ensin voi helposti vaikuttaa siltä, kuin eläin olisi loukannut itsensä. Oireiden pahentuessa eläin ei pääse enää itse ylös makuulta. Eläimellä voi olla myös vaikeuksia esimerkiksi virtsata tai märehtiä. Ataksia voidaan tutkia genomimäärityksen tai erillisen ataksia-testipaketin yhteydessä. Genomitestin yhteydessä tutkimus onnistuu kaikilla näytetyypeillä. Ataksia-testipakettia varten eläimestä tarvitaan kudosnäyte, joka on otettu laboratorion omilla näytteenottovälineillä. Kudosnäytteen voi poikkeuksellisesti ottaa ilman korvamerkin kiinnittämistä. Ataksia-testipaketin yhteydessä saadaan seuraavat tulokset: ataksia, blind, AED, MH ja nupous. Ataksia-määritys kestää 4-5 viikkoa.

BH2 (Brown Swiss Haplotype 2)

BH2 on brown swiss, ayrshire ja simmental roduilla esiintyvä resessiivisesti periytyvä geenivirhe, joka aiheuttaa pieniä ja alikehittyneitä vasikoita. Suurin osa vasikoista syntyy kuolleena tai kuolee pian syntymän jälkeen. Elossa syntyneet vasikat kärsivät tyypillisesti kroonisesta keuhkokuumeesta, mikä hidastaa kasvua ja johtaa usein kuolemaan. Suurin osa näistä vasikoista joudutaan lopettamaan ensimmäisten elinkuukausien aikana. Tautigeeni tutkitaan genomitestauksen yhteydessä. Tutkimus onnistuu kaikilla näytetyypeillä.

Blind eli RP1 (Retinitis Pigmentosa 1)

Blind eli RP1 on resessiivisesti periytyvä sairaus. Sairaus aiheuttaa etenevää verkkokalvon rappeumaa ja sokeutumista, mikäli eläin on tautigeenin suhteen homotsygootti. Sairaus ilmenee usein vasta eläimen ollessa 4-5 -vuotias. Tämä vaikeuttaa myös kantajien tunnistamista. Sairautta esiintyy useilla eri roduilla, mutta sairauden yleisyys rotujen sisällä vaihtelee. Rotuja, joilla sairautta tavataan yleisimmin ovat mm. CHA ja HOL.  RP1 voidaan tutkia genomimäärityksen tai CHA-rodun kohdalla myös ataksia-testipaketin yhteydessä. Genomitestin yhteydessä määritys onnistuu kaikilla näytetyypeillä. Ataksia-testipakettia varten eläimestä tarvitaan kudosnäyte, joka on otettu laboratorion omilla näytteenottovälineillä. Kudosnäytteen voi poikkeuksellisesti ottaa ilman korvamerkin kiinnittämistä. Ataksia-testipaketin yhteydessä saadaan seuraavat tulokset: ataksia, blind, AED, MH ja nupous. RP1-määritys kestää 4-5 viikkoa.

CA (Contractural Arachnodactyly)

CA on anguksella esiintyvä resessiivisesti periytyvä geenivirhe. Vasikat syntyvät yleensä elossa ja suurin osa niistä pystyy myös kävelemään ja imemään. Tyypillisiä oireita ovat kyyryselkäisyys, lantion, takapolvien ja kinnerten jäykkyys sekä vuohisnivelten epämuodostumat. Vasikat syntyvät yleensä normaalipainoisina, mutta ovat rakenteeltaan hentoja ja olemukseltaan muutenkin voimattomia. Tämän vuoksi CA:ta voi olla vaikea havaita. CA:n aiheuttamat rakennevirheet korjaantuvat jossain määrin 4-6 kk:n ikään mennessä, mikä voi vaikeuttaa CA:n tunnistamista eläimen kasvaessa. Yleensä sairaat vasikat ovat kuitenkin lihasköyhiä erityisesti takaosastaan ja jäävät muita vasikoita pienemmiksi. Tutkimus onnistuu Allflexin DNA-korvamerkeillä otetulla kudosnäytteellä tai laboratorion omille näytelapuille otetulla karvanäytteellä. Tutkimus kestää 4-8 viikkoa. Määritys tehdään erillisessä laboratoriossa, joten määritystä ei voi tilata genomitestinäytteestä.

CL16 (nk. Renal Tubular Dysplasia, Claudin 16 Deficiency)

CL16 on wagyu-rodulla esiintyvä resessiivisesti periytyvä geenivirhe. Vasikat syntyvät elossa, mutta niiden kasu ja kehitys on hidasta. Sairaus aiheuttaa munuaisongelmia ja sairaat eläimet kuolevat tyypillisesti 6 vuoden ikään mennessä munuaisten pettäessä. Muihin oireisiin voivat lukeutua ripuli ja sorkkien liikakasvu. Tutkimus onnistuu kaikilla näytetyypeillä. Karva- ja verinäytteiden ottamisessa tulee käyttää laboratorion omia näytteenottotarvikkeita. Määrityksen arvioitu kesto on 4-5 viikkoa. 

DD (Developmental Duplication)

DD on anguksella esiintyvä resessiivisesti periytyvä geenivirhe. Sairaiden vasikoiden uskotaan abortoituvan usein tiineyden alkuvaiheessa. Osa DD-vasikoista syntyy elossa, mutta niillä on havaittavissa eriasteisia kehityshäiriöitä, kuten esimerkiksi ylimääräisiä raajoja, jotka sijoittuvat usein kaulan tai lavan alueelle. Tutkimus onnistuu Allflexin DNA-korvamerkeillä otetulla kudosnäytteellä tai laboratorion omille näytelapuille otetulla karvanäytteellä. Tutkimus kestää 4-8 viikkoa. Määritys tehdään erillisessä laboratoriossa, joten määritystä ei voi tilata genomitestinäytteestä.

Hypotrikoosi

Hypotrikoosi on etenkin herefordilla esiintyvä resessiivisestä periytyvä geenivirhe, joka aiheuttaa vasikalle puutteellisen karvapeitteen. Vastasyntyneillä vasikoilla on usein hyvin lyhyt, hieno ja kihara karva. Joissakin tapauksissa vastasyntyneen vasikan karva voi näyttää huuruiselta tai hopeiselta ja häntäjouhet voivat olla puutteelliset. Tyypillisesti karvaa irtoaa helposti, erityisesti kohdista, joita eläin hankaa. On myös mahdollista, että eläin syntyy täysin karvattomana ja kasvattaa ajan myötä lyhyen kiharan karvan. Eläimen varttuessa sairaus ei ole enää niin helposti havaittavissa. Sairaudesta on olemassa erilaisia ilmenemismuotoja, joita esiintyy eri roduilla. Fabalab-palveluiden kautta hypotrikoosi-tutkimus on mahdollinen vain hereford-rotuisille eläimille. Tutkimus onnistuu kaikilla näytetyypeillä. Tutkimus kestää 4-5 viikkoa.

IARS (Isoleucyl-tRNA Synthetase)

IARS on wagyu-rodulla esiintyvä resessiivisestä periytyvä geenivirhe, joka aiheuttaa pieniä ja heikkoja vasikoita. Tavallisesti elossa syntyneet vasikat ovat aneemisia, apaattisia, alttiita infektioille. imevät heikosti ja kasvavat huonosti. Vasikan ruuminlämpö voi vaihdella ja vasikalla voi olla vaikeuksia seistä ilman avustusta. Osassa tapauksia sikiö kuolee jo tiineyden aikana. Elossa syntyvien vasikoiden osalta tiineysaika on usein hieman normaalia pidempi sikiön heikosta kasvusta johtuen. Tutkimus onnistuu kaikilla näytetyypeillä. Karva- ja verinäytteiden ottamisessa tulee käyttää laboratorion omia näytteenottotarvikkeita. Määrityksen arvioitu kesto on 4-5 viikkoa. 

Kitalakihalkio

Kitalakihalkio on limousinella esiintyvä resessiivisesti periytyvä geenivirhe, jonka seurauksena vasikan kitalaki on tyypillisesti epämuodostunut tai siitä puuttuu osa. Tällöin esimerkiksi imeminen on hankalaa tai mahdotonta. Usein vasikka kuolee pian syntymän jälkeen. Tutkimus onnistuu vain kudosnäytteestä, joka on otettu laboratorion omilla näytteenottovälineillä. Kitalakihalkio-testiä varten kudosnäytteen voi ottaa poikkeuksellisesti ilman korvamerkin kiinnittämistä. Tutkimus on osa kitalakihalkio-testipakettia, jonka yhteydessä saadaan seuraavat tulokset: kitalakihalkio, MH, red factor ja nupous. Tutkimus kestää 4-5 viikkoa. Määritys tehdään erillisessä laboratoriossa, joten määritystä ei voi tilata genomitestinäytteestä.

Mannosidoosi

Mannosidoosi (tyyppi 2) on anguksella esiintyvä resessiivisesti periytyvä geenivirhe, joka aiheuttaa luomisia ja kuolleena syntyneitä vasikoita. Elävänä syntyneet vasikat kuolevat yleensä pian syntymän jälkeen. Harvat yksilöt saattavat elää vuotiaaksi. Elossa syntyneillä vasikoilla voi kuitenkin esiintyä pään vapinaa, koordinaatio-ongelmia ja käyttäytymishäiriöitä, erityisesti aggressioita.

Tiedot testauksesta tulossa.

MD (Mandibulofacial Dysostosis)

MD on herefordilla esiintyvä resessiivisesti periytyvä geenivirhe, joka aiheuttaa pään alueen epämuodostumia. Tavallisesti vasikka syntyy elossa, mutta kuolee pian syntymän jälkeen. Määritys onnistuu kaikilla näytetyypeillä, mutta tätä testiä koskevat näytteenotto-ohjeet tullaan vielä tarkentamaan. Määrityksen arvioitu kesto on 4-5 viikkoa. Määritys tehdään erillisessä laboratoriossa, joten määritystä ei voi tilata genomitestinäytteestä.

MH eli nk. Culard (Muscular Hypertrophy)

Esittelyteksti tulossa.

Tutkimus onnistuu vain kudosnäytteestä, joka on otettu laboratorion omilla näytteenottovälineillä. Kudosnäytteen voi poikkeuksellisesti ottaa ilman korvamerkin kiinnittämistä. Tutkimus on osa ataksia-testipakettia, jonka yhteydessä saadaan seuraavat tulokset: ataksia, blind, AED, MH ja nupous. Määritys kestää 4-5 viikkoa.

MSUD (Maple Syrup Urine Disease)

MSUD on herefordilla esiintyvä resessiivisesti periytyvä geenivirhe, joka aiheuttaa häiriöitä aminohappojen käsittelyssä elimistössä. Sairauden taustalla on virhe entsyymissä, jonka tehtävänä on aminohappojen hajottaminen. Aminohappojen hajottamisen häiriintyessä elimistöön alkaa kertyä aminohappoja ja aineenvaihduntayhdisteitä, jotka ovat haitallisia esimerkiksi aivoille. Vasikat ovat syntyessään normaaleja ja oireita alkaa esiintyä 2-4 vrk iässä, kun aminohappoja aineenvaihduntayhdisteitä alkaa kertyä elimistöön. Tyypillisiä ensioireita ovat vasikan muuttuminen hitaaksi, lisääntynyt makoilu, uneliaisuus ja heikentynyt ruokahalu. Lisäksi aminohappoja ja aineenvaihduntayhdisteitä erittyy virtsaan ja tavallisesti virtsan haju muuttuu niiden myötä makeaksi ja voi muistuttaa jopa poltetun sokerin hajua. Virtsan hajun muuttumisesta juontuu myös sairauden nimi. Aivojen vaurioituessa neurologiset oireet lisääntyvät ja lopulta vasikka useimmiten menehtyy. Määritys onnistuu kaikilla näytetyypeillä, mutta tätä testiä koskevat näytteenotto-ohjeet tullaan vielä tarkentamaan. Määrityksen arvioitu kesto on 4-5 viikkoa. Määritys tehdään erillisessä laboratoriossa, joten määritystä ei voi tilata genomitestinäytteestä.

NH (Neuropathic Hydrocephalus)

NH on anguksella esiintyvä letaali eli kuolemaan johtava geenivirhe. NH periytyy resessiivisesti. Tyypillisesti sairaat vasikat abortoituvat, syntyvät kuolleina tai kuolevat pian syntymän jälkeen. Pää ja selkäydin ovat sairailla vasikoilla nesteen täyttämiä, suurentuneita ja epämuodostuneita. Suuressa osassa tapauksista vasikoilta ei voida havaita varsinaista aivo- ja selkäydinkudosta. Tutkimus onnistuu Allflexin DNA-korvamerkeillä otetulla kudosnäytteellä tai laboratorion omille näytelapuille otetulla karvanäytteellä. Tutkimus kestää 4-8 viikkoa. Määritys tehdään erillisessä laboratoriossa, joten määritystä ei voi tilata genomitestinäytteestä.

Nupous

Nupous-määrityksessä selvitetään, onko nupo eli sarveton eläin nupouden suhteen homo- vai heterotsygootti. Nupous periytyy dominoivasti. Nupous-määritys onnistuu kaikilla näytetyypeillä ja se voidaan tehdä kaikille naudoille rodusta riippumatta. Nupous voidaan tutkia genomimäärityksen, ataksia-testipaketin (CHA) tai kitalakihalkio-testipaketin (LIM) yhteydessä. Genomitestin yhteydessä määritys onnistuu kaikilla näytetyypeillä. Ataksia- ja kitalakihalkio-testipakettia varten eläimestä tarvitaan kudosnäyte, joka on otettu laboratorion omilla näytteenottovälineillä. Kudosnäytteen voi poikkeuksellisesti ottaa ilman korvamerkin kiinnittämistä. Nupousmääritys kestää 4-5 viikkoa.

Protoporfyria

Protoporfyria on limousinella esiintyvä resessiivisesti periytyvä geenivirhe. Jonkin verran geenivirheen kantajia on löydetty myös blonde d’aquitaine- ja simmental-roduista. Protoporfyria aiheuttaa yliherkkyyttä valolle ja tyypillisiä oireita ovat auringonvalosta johtuvat haavaumat ja karvanlähtö. Erityisesti valolle altistuvat vähäkarvaiset ja karvattomat alueet kuten  turpa, korvat, utare ja selkälinja ovat alttiita helposti tulehtuvien haavojen syntymiselle. Sairaat eläimet viihtyvät tyypillisesti varjossa ja ovat haluttomia siirtymään valoon. 

Tiedot testauksesta tulossa.

Red factor

Esittelyteksti tulossa.

Tutkimus onnistuu vain kudosnäytteestä, joka on otettu laboratorion omilla näytteenottovälineillä. Kudosnäytteen voi poikkeuksellisesti ottaa ilman korvamerkin kiinnittämistä. Tutkimus on osa kitalakihalkio-testipakettia, jonka yhteydessä saadaan seuraavat tulokset: kitalakihalkio, MH, red factor ja nupous. Määritys kestää 4-5 viikkoa.

Trombopatia

Trombopatia on simmentalilla esiintyvä resessiivisesti periytyvä geenivirhe, jonka seurauksena eläimen veri ei hyydy normaalisti. Sairaudelle on tyypillistä haavojen verenvuodon heikko tyrehtyminen, nenäverenvuodot sekä anemia, joka on usein seurausta huomaamattomasta sisäisestä verenvuodosta.

Tiedot testauksesta tulossa.